Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CREB3L3Q68CJ9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms