Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATRNL1Q5VV63 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRNL1Q5VV63 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRNL1Q5VV63 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATRNL1Q5VV63 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms