Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RNF20Q5VTR2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF20Q5VTR2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms