Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0F9

CC2D1B, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1BQ5T0F9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CC2D1BQ5T0F9 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CC2D1BQ5T0F9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms