Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PAN3Q58A45 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PAN3Q58A45 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms