Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SBK1Q52WX2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SBK1Q52WX2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms