Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SLC39A12Q504Y0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SLC39A12Q504Y0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms