Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0N0

GGTA1P, Inactive N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1PQ4G0N0 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GGTA1PQ4G0N0 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GGTA1PQ4G0N0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms