Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TTLL9Q3SXZ7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms