Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LETM2Q2VYF4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LETM2Q2VYF4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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