Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KLHL40Q2TBA0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms