Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
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CCDC96Q2M329 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC96Q2M329 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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