Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PTPROQ16827 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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