Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NDUFA9Q16795 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NDUFA9Q16795 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms