Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
FSCN1Q16658 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FSCN1Q16658 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms