Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
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ECM1Q16610 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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ECM1Q16610 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
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ECM1Q16610 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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ECM1Q16610 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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ECM1Q16610 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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ECM1Q16610 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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ECM1Q16610 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ECM1Q16610 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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