Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
FXNQ16595 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
FXNQ16595 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FXNQ16595 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FXNQ16595 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FXNQ16595 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FXNQ16595 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FXNQ16595 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FXNQ16595 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FXNQ16595 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FXNQ16595 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
FXNQ16595 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
FXNQ16595 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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FXNQ16595 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
FXNQ16595 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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