Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LY6EQ16553 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LY6EQ16553 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms