Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
PCSK7Q16549 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PCSK7Q16549 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms