Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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RPE65Q16518 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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RPE65Q16518 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPE65Q16518 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPE65Q16518 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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