Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIC2Q16515 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIC2Q16515 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIC2Q16515 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIC2Q16515 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIC2Q16515 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIC2Q16515 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIC2Q16515 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIC2Q16515 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIC2Q16515 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIC2Q16515 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIC2Q16515 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIC2Q16515 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIC2Q16515 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIC2Q16515 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIC2Q16515 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ASIC2Q16515 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ASIC2Q16515 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms