Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NTRK3Q16288 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
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