Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPRRQ15256 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTPRRQ15256 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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