Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
R3HDM1Q15032 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
R3HDM1Q15032 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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