Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
HERPUD1Q15011 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
HERPUD1Q15011 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms