Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ODF1Q14990 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ODF1Q14990 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms