Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CSHL1Q14406 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CSHL1Q14406 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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