Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CKAP5Q14008 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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CKAP5Q14008 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CKAP5Q14008 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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