Protein–RNA interactions for Protein: Q13683

ITGA7, Integrin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA7Q13683 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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ITGA7Q13683 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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ITGA7Q13683 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
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ITGA7Q13683 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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ITGA7Q13683 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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ITGA7Q13683 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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ITGA7Q13683 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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ITGA7Q13683 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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ITGA7Q13683 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITGA7Q13683 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITGA7Q13683 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
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