Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
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CDH18Q13634 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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CDH18Q13634 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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CDH18Q13634 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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CDH18Q13634 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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CDH18Q13634 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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CDH18Q13634 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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CDH18Q13634 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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CDH18Q13634 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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CDH18Q13634 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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CDH18Q13634 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
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CDH18Q13634 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CDH18Q13634 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
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