Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CUL3Q13618 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL3Q13618 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
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