Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MTMR3Q13615 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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