Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PWP1Q13610 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PWP1Q13610 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms