Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
MSLNQ13421 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MSLNQ13421 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
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