Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PMS2P3Q13401 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PMS2P3Q13401 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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