Protein–RNA interactions for Protein: Q13371

PDCL, Phosducin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCLQ13371 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
PDCLQ13371 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PDCLQ13371 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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