Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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AP3B2Q13367 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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AP3B2Q13367 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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AP3B2Q13367 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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AP3B2Q13367 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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AP3B2Q13367 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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AP3B2Q13367 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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AP3B2Q13367 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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AP3B2Q13367 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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AP3B2Q13367 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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AP3B2Q13367 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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AP3B2Q13367 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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AP3B2Q13367 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
AP3B2Q13367 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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