Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
RIGQ13278 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
RIGQ13278 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
RIGQ13278 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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