Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NME3Q13232 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
NME3Q13232 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
NME3Q13232 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
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NME3Q13232 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
NME3Q13232 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
NME3Q13232 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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