Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PTP4A2Q12974 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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PTP4A2Q12974 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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PTP4A2Q12974 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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PTP4A2Q12974 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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PTP4A2Q12974 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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PTP4A2Q12974 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PTP4A2Q12974 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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PTP4A2Q12974 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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PTP4A2Q12974 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PTP4A2Q12974 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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