Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TP53BP1Q12888 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TP53BP1Q12888 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms