Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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SMARCB1Q12824 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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SMARCB1Q12824 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SMARCB1Q12824 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SMARCB1Q12824 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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