Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCNH2Q12809 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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