Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
EFEMP1Q12805 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EFEMP1Q12805 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms