Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CPSF1Q10570 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
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