Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SSRP1Q08945 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms