Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSME1Q06323 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSME1Q06323 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms