Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTDSPL2Q05D32 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTDSPL2Q05D32 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms