Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SRSF11Q05519 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms