Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ACVR1Q04771 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ACVR1Q04771 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms